在災后重建中，如何科學有效地恢復受損自然植被，恢復大熊貓等野生動物棲息地，恢復大熊貓科研設施，恢復社區基礎設施是重建臥龍自然保護區的關鍵問題，概括起來，臥龍的災后重建工作需要從野外保護、大熊貓科研和社區基礎設施三個方面著手。

2008年11月5日，運用紅外觸發相機陷阱技術，首次在震后監測中拍攝到野生大熊貓。為臥龍自然保護區獲取準確的野生動物分布信息和動態狀況，制訂有效的災后保護管理計劃提供了依據。